MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 23269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021030	CAC	2	6	454079	454084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_021030	CGT	2	6	454112	454117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_021030	ATC	2	6	454182	454187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_021030	TGGA	2	8	454207	454214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021030	GCT	2	6	454256	454261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_021030	GACA	2	8	454263	454270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_021030	TTCC	2	8	454282	454289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_021030	T	6	6	454342	454347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021030	CCG	2	6	454438	454443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_021030	GGT	2	6	454522	454527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021030	GGGC	2	8	454618	454625	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_021030	GCC	2	6	454830	454835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_021030	TGTGC	2	10	454852	454861	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3014	NC_021030	TGCAC	2	10	454897	454906	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3015	NC_021030	ATG	2	6	455124	455129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021030	GCC	2	6	455147	455152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_021030	GGA	2	6	455155	455160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021030	GAT	2	6	455174	455179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021030	CTC	2	6	455258	455263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_021030	GCT	2	6	455272	455277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_021030	TCG	2	6	455316	455321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_021030	CCG	2	6	455322	455327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_021030	CGT	2	6	455393	455398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_021030	CGT	2	6	455419	455424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_021030	GCC	2	6	455496	455501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_021030	GCG	2	6	455553	455558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_021030	TCC	2	6	455580	455585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_021030	CCG	2	6	455598	455603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_021030	CGT	2	6	455614	455619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_021030	CGA	2	6	455650	455655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_021030	AGC	2	6	455688	455693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_021030	T	6	6	455699	455704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021030	TCG	2	6	455727	455732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_021030	TTG	2	6	455751	455756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021030	GAA	2	6	455807	455812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021030	GGC	2	6	455815	455820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021030	GAC	2	6	455867	455872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_021030	TC	3	6	455884	455889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_021030	GCT	2	6	455902	455907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_021030	GCA	2	6	455926	455931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_021030	GTTGCA	2	12	456010	456021	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3042	NC_021030	GCG	2	6	456045	456050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_021030	CGG	2	6	456055	456060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_021030	TGA	2	6	456130	456135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021030	TTC	2	6	456176	456181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_021030	CGG	2	6	456187	456192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_021030	CGTC	2	8	456213	456220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_021030	TGT	2	6	456364	456369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021030	TC	3	6	456397	456402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_021030	GGT	2	6	456404	456409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_021030	GAT	2	6	456410	456415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021030	GTC	2	6	456419	456424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_021030	GCC	2	6	456443	456448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_021030	CGT	2	6	456484	456489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_021030	GTC	2	6	456611	456616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_021030	GTT	2	6	456620	456625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021030	TGC	2	6	456673	456678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_021030	AGC	2	6	456741	456746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_021030	CGGT	2	8	456759	456766	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_021030	CCA	2	6	456776	456781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_021030	TTG	2	6	456789	456794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021030	CGT	2	6	456835	456840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_021030	GGTT	2	8	456841	456848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021030	TTTG	2	8	456865	456872	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021030	CGA	2	6	456880	456885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_021030	GCC	2	6	456917	456922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_021030	TCG	2	6	457014	457019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_021030	AGG	2	6	457104	457109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021030	GCA	2	6	457273	457278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_021030	TGC	2	6	457279	457284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_021030	CGG	2	6	457290	457295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_021030	GGT	2	6	457304	457309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021030	TTTCG	2	10	457364	457373	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3074	NC_021030	TGC	2	6	457387	457392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_021030	GCC	2	6	457524	457529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_021030	TGT	2	6	457657	457662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021030	TCGA	2	8	457746	457753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_021030	TCA	2	6	457765	457770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_021030	GTT	2	6	457781	457786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021030	TGA	2	6	457804	457809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_021030	TTG	2	6	457833	457838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021030	CCA	2	6	457846	457851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_021030	GAG	2	6	457926	457931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021030	GGTC	2	8	458005	458012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3085	NC_021030	ATCC	2	8	458052	458059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3086	NC_021030	TCG	2	6	458064	458069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_021030	TCC	2	6	458100	458105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_021030	TGG	2	6	458116	458121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021030	CCG	2	6	458142	458147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_021030	ATG	2	6	458160	458165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021030	TGA	2	6	458194	458199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021030	CCT	2	6	458203	458208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_021030	CG	3	6	458228	458233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_021030	CGT	2	6	458275	458280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_021030	GTC	2	6	458306	458311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_021030	GTTG	2	8	458392	458399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021030	GCC	2	6	458423	458428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_021030	TCTT	2	8	458448	458455	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_021030	GCCC	2	8	458521	458528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3100	NC_021030	AGC	2	6	458529	458534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_021030	AGC	3	9	458538	458546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_021030	CGG	2	6	458602	458607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_021030	GGGA	2	8	458608	458615	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021030	TTG	2	6	458688	458693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021030	GCC	2	6	458694	458699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3108	NC_021030	CGGC	2	8	458903	458910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_021030	GCA	2	6	458929	458934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_021030	GTCG	2	8	458951	458958	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_021030	GCC	2	6	458999	459004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_021030	CCA	2	6	459107	459112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_021030	AGG	2	6	459189	459194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021030	GTT	2	6	459281	459286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021030	TCCAC	2	10	459292	459301	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3116	NC_021030	GCG	2	6	459333	459338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_021030	TCC	2	6	459348	459353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_021030	CGC	2	6	459436	459441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_021030	CGC	2	6	459480	459485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_021030	TTG	3	9	459495	459503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021030	CGC	2	6	459520	459525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_021030	TCG	2	6	459663	459668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_021030	GCC	2	6	459741	459746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_021030	CCT	2	6	459781	459786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_021030	GTC	2	6	459845	459850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_021030	CGC	2	6	459851	459856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_021030	GCGTT	2	10	459936	459945	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3128	NC_021030	CGT	2	6	459956	459961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_021030	TTG	2	6	460020	460025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021030	CGA	3	9	460087	460095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_021030	ACC	2	6	460266	460271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_021030	TCT	2	6	460411	460416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_021030	GCG	2	6	460462	460467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_021030	GTT	2	6	460469	460474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021030	CTC	2	6	460529	460534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3136	NC_021030	TCG	3	9	460551	460559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_021030	TCG	2	6	460563	460568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_021030	TCC	2	6	460611	460616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3139	NC_021030	GTT	2	6	460622	460627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_021030	N	395	395	460631	461025	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_021030	CTC	2	6	461080	461085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3142	NC_021030	CCT	2	6	461109	461114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3143	NC_021030	CCG	2	6	461141	461146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3144	NC_021030	GAT	2	6	461155	461160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3146	NC_021030	GACC	2	8	461272	461279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3147	NC_021030	TTG	2	6	461339	461344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_021030	CAG	2	6	461395	461400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_021030	AGC	2	6	461402	461407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3150	NC_021030	CTGT	2	8	461453	461460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3151	NC_021030	T	7	7	461483	461489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_021030	GTTC	2	8	461490	461497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3153	NC_021030	CGGA	2	8	463866	463873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3154	NC_021030	TAA	2	6	470471	470476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3156	NC_021030	TCT	2	6	470630	470635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3157	NC_021030	TTA	2	6	470650	470655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3162	NC_021030	T	6	6	473372	473377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3164	NC_021030	TCG	2	6	475828	475833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3166	NC_021030	TCCG	2	8	475876	475883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3167	NC_021030	CGGA	2	8	475902	475909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3168	NC_021030	GAC	2	6	477737	477742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3170	NC_021030	T	6	6	477877	477882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3171	NC_021030	CTTT	2	8	477915	477922	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3173	NC_021030	TCG	2	6	479067	479072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3175	NC_021030	AT	4	8	479115	479122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3176	NC_021030	AC	3	6	479207	479212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3177	NC_021030	TC	3	6	479249	479254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3180	NC_021030	A	7	7	479335	479341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3182	NC_021030	TTG	2	6	483414	483419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3185	NC_021030	TAG	2	6	487484	487489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3187	NC_021030	T	7	7	487591	487597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3204	NC_021030	CTG	2	6	488573	488578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3250	NC_021030	CGC	2	6	501180	501185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3251	NC_021030	GGC	2	6	501234	501239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3252	NC_021030	GTTT	2	8	501264	501271	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_021030	GCC	2	6	501308	501313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_021030	CGT	2	6	504775	504780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_021030	TCGA	2	8	504827	504834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3256	NC_021030	T	7	7	504843	504849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_021030	T	7	7	504874	504880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_021030	CCGG	2	8	508061	508068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3259	NC_021030	TC	3	6	508079	508084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_021030	CGAAAA	2	12	508090	508101	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3261	NC_021030	AAGG	2	8	508102	508109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_021030	CCTT	2	8	508116	508123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_021030	TGG	2	6	508236	508241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_021030	ATTT	2	8	508255	508262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_021030	GT	3	6	508301	508306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_021030	T	6	6	508306	508311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_021030	GCC	2	6	508331	508336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3403	NC_021030	GCG	2	6	536988	536993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3404	NC_021030	TAAA	2	8	537634	537641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3405	NC_021030	TTA	2	6	537648	537653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3445	NC_021030	A	6	6	539796	539801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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